При грі на балалайці використовують металеві, житлові та капронові струни. Першу струну найчастіше роблять із металу (товщиною 0.28-0.30 мм.), але можна поставити і жильну (нейлонову або капронову). Дві інші – найчастіше житлові чи капронові – завтовшки 0.9-1.0 мм.
Балалайка Перша струна (налаштувати на А першої октави) металева, товщиною від 0,28 мм (зазвичай це перша струна від комплекту для гітари, мандолини і т. п.) Друга і Третя ОДНАКОВІ -синтетика (налаштувати в унісон на Е першої октави) підходить струна №3 G із комплекту для класичної гітари.
Існує також народний лад — перша струна Сіль, друга Мі, третя До (за мажорним тризвучтям До). При цьому лад простіше беруться тризвучтя, проте недоліком його є утрудненість гри по відкритим струнам.
Налаштування балалайки потрібно починати з першої струни (найтоншої). Перша струна на балалайці Ля, друга та третя – Мі. Можна, можливо налаштувати балалайку використовуючи звичайну шестиструнну гітару. Ля на балалайці налаштовується по 5 ладу першої струни гітари.