Настойку слід приймати як більшість фітопрепаратів. Невелика кількість засобу (0,5 1 чайна ложка) розбавити 50-100 мл теплої води, приймати 3 рази на день після їди або за півгодини до їди.
від 10 крапель до 1 чайної ложки 4-5 разів на добу. Зовнішньо використовують у формі аплікацій під повязки та зрошень.
У народній медицині настоянку плодів софори застосовують зовнішньо як ранозагоювальний засіб при глибоких пораненнях, трофічних виразках. Усередину, цю настоянку призначають при гіпертонічній хворобі, виразковій хворобі, внутрішніх кровотечах. Настоянку також застосовують при лікуванні екземи, абсцесів.
Курс прийому софори японської становить 1 місяць, потім перерва щонайменше ніж 2-3 тижня. У сухому прохолодному місці.