У звичайної амебиЯк і у більшості тварин, в цитоплазмі розташоване лише одне ядро.
Серед клітинних органел можна виділити одне ядро, одну скорочувальну вакуолю та безліч травних вакуолей, а також гранул запасних речовин (різних полісахаридів, ліпідних крапель, численних кристалів).
Просвітня форма оточується оболонкою і перетворюється на кулясту цисту (Розмір близько 12 мкм) з 4 ядрами, які не відрізняються за будовою від ядра вегетативної форми.